C 22 июня 2012 года для пассажиров авиакомпании "Трансаэро", вылетающих из аэропортов Санкт-Петербурга (Пулково), Денпасара (Нгурах-Рай) и Шарм-эль-Шейха (Офира), появилась возможность воспользоваться современной услугой "Мобильная регистрация"при помощи мобильного телефона, перейдя по ссылке transaero.mobi в браузере мобильного устройства или воспользовавшись специальным приложением, разработанным для iPhone и Android.

С 19 июля 2012 года мобильная регистрация на рейсы "Трансаэро"стала доступна из аэропортов Алматы, Астаны и Барселоны (Эль-Прат).

С 2010 года Трансаэро предлагает своим пассажирам услугу "Мобильная регистрация на рейсы". Система сама находит нужный рейс и предлагает выбрать место в салоне самолета на схеме мест. По окончании регистрации пассажиры получают посадочный талон в формате 2D штрих-код или ссылку на него.

В настоящее время услуга мобильной регистрации доступна для пассажиров "Трансаэро", вылетающих из 21 аэропорта, как на внутренних, так и на международных рейсах:

Домодедово, Шереметьево, Внуково, Владивосток, Екатеринбург, Новосибирск, Санкт Петербург, Сочи, Томск, Уфа, Хабаровск, Алматы, Астана, Ереван, Барселона, Берлин, Вена, Вильнюс, Денпасар, Тель-Авив, Франкфурт, Шарм-эль-Шейх.

Для удобства пассажирам, прошедшим онлайн или мобильную регистрацию и при этом путешествующим с багажом, предоставляется возможность оформить багаж на специальных стойках сдачи багажа в аэропорту (DROP-OFF).